Actualmente es posible tratar muchos problemas congénitos cardiacos sin cirugía, mediante la realización de cateterismo cardiaco donde se pueden introducir dispositivos para cierre de defectos, los más comunes son la PCA (persistencia del coducto arterioso) y la CIA (comunicación interauricular).
También es posible realizar dilataciones con balón intraarterial como en el caso de la coartación aórtica. Existen otros problemas que pueden ser tratados mediante cateterismo cardiaco con la ventaja de tener menos riesgo que una cirugía, menor tiempo de estancia hospitalaria, recuperación muy rápida e incluso un menor costo respecto a una cirugía cardiovascular. La mayor parte de los procedimientos se pueden realizar en un día con egreso del paciente al día siguiente.